样本数据预处理
- 不同物质适合不同采集模式，有些物质只能在正离子检出或正离子响应较佳，同样，有些物质只能在负离子检出或负离子响应较佳。在实验过程中有些物质可能在正离子响应，有些物质可能在负离子模式下可以响应，为了使样品中检测到的物质更加全面，所以分别采用正负离子模式采集数据。
- 通过LipidSearch软件（v4.2）对采集到的原始数据（*.raw格式）逐个进行脂质注释，得到包括质核比（mass to charge ratio, m/z）和保留时间（retention time,rt及峰响应值（intensity）等信息的数据矩阵。
- 将所有样本的注释结果，通过LipidSearch软件（v4.2）进行alignment，对所有单个样本的正负离子模式注释结果进行峰对齐、峰过滤等工作，主要参数有 R.T.Tolerance=0.25，m-Score Threshold=5[1]。正负离子模式下均存在的物质则保留峰响应值高、QC样本中RSD值较小的物质。
- 为使不同量级的数据能够进行比较，对数据进行峰响应值的 总峰归一化。
数据预处理附件
数据预处理数据文件：lipidomics.xlsx
lipidomics.xlsx 里面包含“raw”和“normalized”、“lipid_classification_stats”三个工作簿，其中“raw”工作簿是数据归一化前的脂质数据，“normalized”工作簿是经过归一化等预处理后的数据，“lipid_classification_stats”工作簿是根据脂质的化学结构得到的分类信息。