首先，将所有测得分子量进行鉴定后获得的鉴定代谢物，根据KEGG和Metabolon.inc中对代谢物的分类，对物质进行功能分类，分为Carbohydrate、Energy、Lipid、Nucleotide、Amino acid、Xenobiotics、Peptides、Cofactors and Vitamins等类别。

其次，将所有测得分子量进行鉴定后获得的鉴定代谢物，可以根据代谢物结果对物质进行分类，选取TOP10或15的类别绘制饼图。

对于粪便或肠道内容物等样本，还将所有测得分子量进行鉴定后获得的鉴定代谢物，可以根据来源（人类特有代谢物：human_specific；微生物特有代谢物：gut_specific；共有代谢物：common）对物质进行分类，并绘制饼图。