由于代谢组数据具有多维且某些变量间高度相关的特点，运用传统的单变量分析无法快速、充分、准确地挖掘数据内潜在的信息。因此在分析代谢组数据需要运用化学计量学原理和多元统计的方法，对采集的多维数据进行降维和归类分析，从而挖掘提炼出最有用的信息。

标准化处理
通常，在对代谢组学数据进行多元统计分析之前, 需要将数据进行适当权重转换，即标准化（scaling）处理。目前代谢组学研究常用的数据标准化方式有中心化处理（Mean-centering and not scaling, Ctr）、自适换算（Autoscaling， Mean-centering and scaled to unit variance, UV）、帕莱托换算（Pareto scaling，Mean-centering and scaled to pareto variance，Par）等。
本实验在多元统计分析前对数据进行自适（uv）换算处理，以获得更加可靠且直观的结果。

具体分析方法
本分析中使用的多元统计分析（R语言ropls包[1]）方法有：
  1. 主成分分析 （Principal Component Analysis, PCA）
  2. 偏最小二乘判别分析 （Partial Least Squares-Discriminant Analysis, PLS-DA）
  3. 正交-偏最小二乘判别分析 (Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis, OPLS-DA）