差异脂质热图
聚类分析被用于判断代谢物在不同实验条件下的代谢模式。以不同实验条件下脂质的相对值为代谢水平,做层次聚类(hierarchical clustering)分析,结果以热图表示。热图表现的是一个数据矩阵,通过使用颜色梯度使数据间的差异实现可视化,通过数据缩放,保留较大差异,同时也能突显较小差异。不同颜色的区域代表不同的聚类分组信息,同组内的代谢模式相似,可能具有相似的功能或参与相同的生物学过程。因此通过将代谢模式相同或者相近的物质聚成类,可以用来推测已知或未知脂质的生物学功能。
本实验采用凝聚层次聚类(agglomerate hierarchical clustering):即将每个对象归为一类,合并这些类成为越来越大的对象,直到终结。通过R(v3.3.2)中pheatmap程序包对数据集进行缩放,得到脂质相对定量值层次聚类图如下:图中相对含量的大小通过颜色的不同来显示,其中列代表样本,行代表脂质。
图:差异脂质热图