样本数据预处理
- 通过LipidSearch软件(v4)将获得的原始数据(*.raw格式)逐个进行脂质注释,得到包括质核比(mass to charge ratio, m/z)和保留时间(retention time,rt)及峰响应值(intensity)等信息的数据矩阵。
- 将所有样本的注释结果,通过LipidSearch软件(v4.0)进行alignment,对所有单个数据的注释结果进行峰对齐、峰过滤等工作,主要参数有 R.T.Tolerance=0.25,m-Score Threshold=2 。
- 为使不同量级的数据能够进行比较,对数据进行峰响应值的 脂类内部归一化 。
数据预处理附件
数据预处理数据文件:lipidomics.xlsx
lipidomics.xlsx 里面包含“raw”和“normalized”、“lipid_classification_stats”三个工作簿,其中“raw”工作簿是数据归一化前的脂质数据,“normalized”工作簿是经过归一化等预处理后的数据,“lipid_classification_stats”工作簿是根据脂质的化学结构得到的分类信息。